كشف تحقيق أجرته (الجريدة) عن تزوير في شهادات الطلاب بالجامعة المفتوحة وأن عميد كلية اللغات السابق (المدير الحالي) د.عبدالخالق فضل الله رحمة منح درجات اضافية لطلاب دون وجه حق بلغ عددهم في فرع الخرطوم فقط 95 طالباً ، فيما تمكنت الحركة الاسلامية من السيطرة على مفاصل الجامعة مجدداً بعد الانقلاب وتولى مسؤولها إدارة الفروع فضلاً عن التجاوزات الادارية والمالية وسياسة المحاباة والتمييز القبلي .